PCNL, genellikle 2 cm ve üzeri böbrek taşlarının tedavisinde uygulanmaktadır. Böbrek hizasına bir cm boyutundaki kesiden, özel bir takım aletler yardımıyla ciltten böbreğe bir boru parçası yerleştirilmektedir. Optik cihaz yardımıyla böbrek içindeki taş video sistemi ile monitörde görülmektedir. Lazer yardımı ile taş kırılmakta ve forsepsler yardımıyla vücut dışına alınmaktadır. Açık böbrek ameliyatlarına göre iyileşme süreci oldukça hızlı olan bu yöntemde, hasta iki gün gibi kısa bir sürede günlük aktivitelerini gerçekleştirebilmektedir.